本校では、体育・文化活動を通じて心身を練磨し、幅広い人間性を養うとともに、相互の親睦をはかるため、学友会を組織して、次の部及び同好会が学生の手により自主的に運営され活躍しています。

空手道、剣道、柔道、硬式テニス、ハンドボール、サッカー、バスケット、バドミントン、バレーボール、ラグビー、準硬式野球、水泳、躰道、合気道、弓道、スキー、陸上競技、レスリング、自転車競技、山岳同好会、ソフトボール同好会

囲碁・将棋同好会、医用工学研究（ＭＥ）、演劇、音楽、合唱、茶道、写真、書道、吹奏楽、弦楽アンサンブル、美術、分子医学研究（ＭＭ）、国際医学生連盟防衛医科大学校支部（ＮＡＭＩＡ）、ディベート同好会、ダンス同行会、ＥＳＳ同好会